根据《习水县人民政府办公室关于印发习水县民族宗教事务局职能配置、内设机构和人员编制规定》（习府办发[2002]83号）和习编办通(2005)17号精神，设置3个职能科室：
（一）办公室、（二）民族股、（三）宗教股。机关行政编制为3名。其中：局长1名，副局长1名；主任科员或副主任科员1名,正副股(室)长(主任)3名。机关后勤服务人员事业编制1名。无下属机构。
工作职能：
（一）贯彻执行党和国家关于民族宗教工作的方针、政策。制订全县民族宗教工作的管理办法，并组织实施。
（二）负责全县有关民族宗教理论、政策和重大问题的调查研究，掌握全县民族、宗教工作动态，并提出建议和意见。
（三）负责民族宗教政策、法规的宣传教育工作，促进各民族间的平等团结、互助合作 ，维护社会稳定。
（四）负责全县贯彻落实少数民族经济、文化、教育和体育事业等的优惠政策。联系少数民族干部，协助组织、统战、人事部门做好民族干部的培养、选拔和任用工作。负责全县少数民族权益保障事宜。
（五）依法保护全县公民宗教信仰自由，保护全市各宗教团体和宗教活动场所的合法权益，保护宗教教职人员履行正常的教务活动，保护信教群众正常的宗教活动。
（六）负责查处全县违反民族宗教法律、法规的案件，防止和制止不法分子利用民族宗教进行非法活动。
（七）负责培训全县民族宗教工作人员。参与对少数民族代表人物和宗教上层人士的政治安排。帮助宗教团体培养、教育宗教教职人员。
（八）指导、协调全县民族、宗教团体有关事务，负责全县少数民族、宗教界人士的学习、参观、考察活动的有关事宜。